不明原因发热（FUO）是一个复杂的医疗难题，其常见原因包括感染、恶性肿瘤和胶原血管病，而其中恶性肿瘤仅占成人FUO案例的14%。许多患者最初因发烧、疼痛或疲劳等不特异性症状就医，而这些症状往往经过初步治疗后，最终确认为癌症。常规的体检和血清学检查往往难以区分癌症与其他疾病，而活检和组织学染色长期以来被视为癌症诊断的金标准。此外，正电子发射断层扫描/计算机断层扫描（PET/CT）是现代医学在癌症诊断和分期方面的常规手段。然而在临床初次诊断主要考虑到传染病时，相关的肿瘤检查可能会被延误，导致诊断的推迟。因此，如果能通过单一的检测同时确认病原体和肿瘤的存在，就能显著提高对发热患者的诊断准确性。

宏基因组下一代测序（mNGS）技术代表了分子诊断领域的一次革命，尤其在传染病的检测和诊断中展示了其不可替代的价值。该技术独树一帜，因为它无需依赖于任何预设假设或传统的微生物培养方法，能够直接从各类样本中，包括血液、体液和活检组织，进行病原体的检测。此外，mNGS的应用远不止于病原体识别，它已经证明在临床上有着广泛的用途，如近期研究显示，通过mNGS从体液和脑脊液中识别肿瘤的总体敏感性达到了87%，特异性更是达到了100%。

在肿瘤学研究中，基因组不稳定性被广泛认为是肿瘤细胞的一个标志，特别是染色体拷贝数变异（CNV）被视为肿瘤发展和进展的关键遗传特征。近年来，随着对染色体CNV在早期癌症诊断中作用的日益关注。mNGS在同时检测感染和癌症方面展现出巨大的潜力，通过对宿主细胞和微生物的DNA进行测序，为双重诊断提供了强有力的工具。本研究通过对8例发热性疾病患者应用mNGS，成功检测出指示肿瘤存在的CNV。这些发现随后通过病理染色得到验证，为患者提供了及时的、适当的抗癌治疗指导，开辟了诊断和治疗新途径。